TP - Programmation Python pour la BIOInfo

On peut également créer des scripts en python pour pouvoir lancer une longue série d'opérations, déclarer des fonctions, des classes etc ...

Vous pouvez créer un fichier que vous terminerez par l'extension .py

Cette extension n'est pas indispensable, mais elle vous permettra de savoir qu'il s'agit d'un script python juste en regardant le nom de fichier.

Cela permettra également aux éditeurs de texte de savoir mettre en e couleur correctement votre script, cela permettra à certaines environnements d'exécuter votre script correctement avec python en double-cliquant dessus

Les principaux éditeurs sous UNIX sont : geany, kate, gedit, nedit, xemacs et vi.

Sous Windows il existe par exemple wordpad et notepad++.

Vous pouvez également utiliser des environnements de programmation plus complets comme IDLE, PythonWin, ou PyDev sous Eclipse

Certains éditeurs vous apporterons des facilités de codage comme la coloration syntaxique, la complétion de code ou le mode débuggage.

Il existe plusieurs façon de lancer votre script :

1. Taper python3 monscript.py

2. Modifier votre fichier pour qu'il puisse etre executer automatiquement en entrant son nom. Pour cela :

   • il faut que la premi`re ligne de votre programme soit la suivante : « #!/usr/bin/env python3 »

   • rendre votre fichier exécutable grâce a la commande :

     chmod +x monscript.py

   Il suffit ensuite de taper ./monscript.py pour l'executer.